С 3 июля 2012 «Рубин» официально использует новый логотип, пришедший на смену эмблеме, разработанной в 1997 году. Главный элемент логотипа – изображение дракона Зиланта, остался прежним, претерпев лишь стилистические изменения.

Новый логотип представляет собой стилизованное изображение камня Рубин, выполненное в цветах татарстанского клуба. В эмблему заключены изображение Зиланта, название клуба, название города и год основания клуба. Основным критерием при разработке нового логотипа являлось сохранение преемственности с многолетней историей эмблемы «Рубина».

1. Там, где Восток соединяется с Западом (зеленая и красная полосы флага Республики Татарстан).
2. Где народы живут в единстве и согласии (белая полоса флага).
3. Началась новая эпоха (1958 - дата основания клуба).
4. Эпоха команды, сила духа которой наполнена энергией тысячелетнего города (Kazan).
5. Эпоха команды, чье неудержимое стремление к новым вершинам подобно полету крылатого Зиланта – древнего символа Казани (Зилант).
6. В наших сердцах горит жаркий огонь, словно пламя Зиланта, ярко освещая путь к поставленным целям (пламя Зиланта).
7. Мы расширяем границы своих возможностей, воплощая в жизнь невозможное (разомкнутые контуры логотипа).
8. Наша вера в победу крепче камня (форма логотипа).
9. Мы – Футбольный Клуб Рубин (футбольный клуб Рубин).